眼视光学和视觉科学国家重点实验室主任、国家眼视光工程技术研究中心主任、国家药监局眼科疾病医疗器械和药物研究与评价重点实验室主任、教育部近视诊疗与防控工程技术中心主任、海南乐城真实世界研究院理事长、国务院学位办临床医学学科评议组专家、教育部教学指导委员会眼视光医学委员会主任委员、中国眼视光学专委会主任、教育部全国综合防控儿童青少年近视专家宣讲团团长、中国老年医学学会副会长、眼科学分会主任委员、中华医学会眼科学会副主任委员、中国高等教育学会常务理事、浙江省高等教育学会会长等。原温州医科大学校长（2002.5~2015.10）。

主持973项目（首席科学家）、国家自然科学基金重点项目等百多项；发表SCI论文近300篇，授权发明专利近50项；获国家科技进步二等奖两项（均排名第一），获何梁何利奖和谈家桢奖；获中华医学科技一等奖等省部级科技奖多项；连续多年入选爱思唯尔中国高被引学者（临床医学）榜单。创建并主编《Eye & Vision》、《中华眼视光学与视觉科学杂志》和《医学参考报眼科频道》等期刊和报纸。

主编眼视光学规划教材（国家规划教材共21本，共出三版），主编《眼科学》教科书（为国家规划教材、国家精品课程等）获全国首届优秀教材奖；获国家教学成果二等奖三项。

瞿佳教授先后获得国家万人计划、国家教学名师、全国模范教师、全国优秀医院院长、卫生部有突出贡献中青年专家、浙江省首批特级专家等称号；并获亚太眼科学会和中华眼科学会特殊贡献奖、杰出贡献奖等。鉴于瞿佳对中国乃至国际视光学教育的贡献，2012年美国视光学高等教育学会授予眼视光卓越领导奖；2002年美国新英格兰视光学院授予瞿佳荣誉博士学位，2013年美国纽约州立大学荣誉博士学位。